La conformazione geologica dell'isola caratterizza anche i suoi fondali, creati da strutture laviche di particolare morfologia. Vi sono pareti, alcune "tremendamente" nette e dritte verso gli abissi, secche, anfratti, tunnel e passaggi che divertirebbero qualsiasi subacqueo, dal neofita al più esperto. Ma è la ricchezza di vita che rende le immersioni a Linosa indimenticabili: nonostante l'isola sia da pochissimi anni costituita come riserva marina, sembra che lo sia da sempre.

Il Mediterraneo è quello di una volta, dove il pesce pelagico è di casa e la vita sessile cresce rigogliosa. Le particolarità delle sue acque sono l'estrema limpidezza e l'aspetto quasi tropicale. Sì, perché è la porta d'ingresso dal mediterraneo orientale ormai quasi tropicalizzato verso quello europeo, ottenendo una particolare mescolanza.

Tuttavia non vi è  un'elevata biodiversità: le cernie sono dominanti, alcune quasi addomesticate, e la parete presenta, secondo i subacquei italiani, una lacuna notevole: la gorgonia, in tutte le sue forme. Ma sono i colori delle spugne, dei nudibranchi, dei pesci pappagallo e dei "nuovi" esemplari - fra cui il pesce coniglio e lo scorfano di Madeira -  ad adornare le sue pareti. Inoltre, non mancano gli incontri con diverse specie di carangidi (fra cui Caranx crysos e Caranx hyppos), tonni e vari pesci in branco.

Linosa offre circa 10 siti d'immersione,

La maggior parte dei siti d'immersione sviluppano diversi itinerari, ampliando così la varietà della tipologia delle immersioni. Abbiamo creato infatti percorsi di vario livello, per principianti ed esperti, della durata mai inferiore ai  50 minuti.

Qui di seguito sono elencati i luoghi d'immersione ed il posizionamento sulla mappa.

1. Secchitella 2. Punta Calcarella 3. Archi Naturali 4. Secca di Tramontana 5. Tre Dita 6. Ai Fil  7. Mannarazza	8. Costone del Soldato  9. Balata Piatta 10. Secca di Levante 11. Piscine 12. Scoglio P.Tuccio 13. Secca Maestra